Сюжет 

Главный герой серии, подросток Наруто Узумаки, является носителем девятихвостого демона-лиса, запечатанного в его теле. За двенадцать лет до начала событий, излагаемых в манге, демон-лис напал на деревню Скрытой Листвыродную деревню Наруто. Ради спасения Конохи четвёртый хокагэ, глава селения, пожертвовал жизнью, чтобы запечатать дух демона внутри своего новорождённого сына Наруто. Хокагэ желал, чтобы люди считали Наруто героем, поскольку он отныне сдерживал мощь девятихвостого лиса, однако население деревни восприняло Наруто как демона во плоти и возненавидело его. Поскольку упоминать об атаке лиса было запрещено, Наруто узнал о своей необычности лишь случайно, годы спустя.части. В начале первой части Наруто с большим трудом завершает обучение и получает звание гэнина - начинающего ниндзя. Он и двое его одноклассников, Саскэ Утиха и Сакура Харуно, образуют команду под началом опытного сэнсэя Какаси Хатакэ. По мере развития сюжета Наруто находит новых друзей среди жителей деревни и овладевает новыми способностями, считая их необходимыми для того, чтобы в будущем исполнить свою мечту - стать хокагэ. Вскоре Коноха подвергается атаке: беглый ниндзя и разыскиваемый преступник Орочимару вместе со своими приспешниками нападает на селение ,  убивая его главу - третьего хокаге . Будучи в состоянии меняться телами с другими людьми, Орочимару желает заполучить тело Саске Учихи, считая его наследственные способности подходящими для себя, так как Саскэ является представителем клана Утиха, наиболее одарённого среди ниндзя. Саскэ добровольно уходит к Оротимару, полагая, что тот даст ему возможность стать сильнее и отомстить своему старшему брату Итати. До начала событий манги Итати уничтожил весь клан Утиха за исключением Саскэ, для которого месть превратилась в смысл жизни. Наруто, желая вернуть ушедшего Саске ,  покидает Коноху и посвящает себя тренировкам. Он занимается с легендарным ниндзя Дзирайей, бывшим товарищем Оротимару, чтобы подготовиться к следующей встрече и возможной битве с Саскэ., описывает события, происходящие через два с половиной года после первой. После тренировок с Дзирайей Наруто возвращается в деревню Скрытой Листвы и воссоединяется с оставленными друзьями. Команда   7, ранее состоявшая из Наруто, Саскэ и Сакуры, переформировывается. Теперь она называется Команда Какаси , а место Саскэ занимает другой молодой ниндзя - Сай. Все одноклассники Наруто также взрослеют за это время: если в начале повествования главным героям было по 12-13 лет, то теперь - 15-16. Ведущую роль противников Наруто и его друзей вместо Орочимару занимает организация Акацуки, члены которой стремятся захватить всех хвостатых демонов, включая и девятихвостого лиса, заточённого внутри Наруто. После жестокого боя с Акацуки , в котором не последнюю роль играет Наруто , побеждающий лидера организации - Пэйна , жители Конохи отстраивают разрушенное селение заново. Тем временем Саскэ, закончивший обучение у Орочимару , предаёт его и отправляется к Итачи , чтобы отомстить за уничтожение клана. Итачи погибает в битве, а Саске узнаёт  , что убийства клана Учиха было санкционировано высшим руководством Конохи . Обозлённый этим открытием , Саске присоединяется к организации Акацуки, чтобы уничтожить Коноху .